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Développement de méthodes expérimentales et computationnelles pour optimiser la production de métabolites et de protéines recombinantes
Thibault Clavier, Hans Geiselmann, Eugenio Cinquemani, Hidde de Jong, Delphine Ropers
Cette recherche fait l'objet d'un projet SATT avec le service de valorisation de l'Université Grenoble Alpes et le service STIP de l'Inria pour l'accompagnement du projet.
Nous utilisons des méthodes d’ingénierie génomique pour modifier le contrôle du métabolisme bactérien et de la synthèse protéique, ce qui permet de réorienter des ressources de la croissance vers la production de métabolites et de protéines recombinantes. Nous avons notamment développé un « growth switch » (ou « commutateur de croissance ») qui nous permet d'induire ou d'éteindre par un signal extérieur (chimique) l’expression des gènes de l’ARN polymérase chez Escherichia coli, et ainsi contrôler la croissance des bactéries.
En opérant le growth switch, nous avons montré que le rendement de production de métabolites d’intérêt peut être augmenté de façon significative, dans des bioréacteurs à l’échelle de quelques litres. Nous travaillons actuellement sur des approches pour rendre le système d’induction plus flexible et économique (en explorant l’optogénétique) et pour optimiser les schémas d’induction afin d’atteindre des rendements ou des vitesses de production maximales (par méthodes de contrôle optimal). Une de ces approches fait l'objet du projet de maturation Switch2Prod conduit par Thibault Clavier et accompagné par la SATT Linksium et le service transfert innovation et partenariat de l'Inria.
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