Écosystèmes bactériens synthétiques

Eugenio Cinquemani, Hans Geiselmann, Hidde de Jong, Aline Marguet

Les communautés microbiennes synthétiques attirent de plus en plus l’attention pour la recherche fondamentale ainsi que pour les applications biotechnologiques. Des consortiums d'un petit nombre d'espèces peuvent être cultivés en laboratoire plus facilement que des communautés naturelles complexes, et ils permettent une compréhension et une caractérisation précises des interactions symbiotiques que l'on retrouve dans les environnements naturels. De plus, il est désormais démontré qu’en exploitant des interactions appropriées, il est possible d’utiliser des consortiums de synthèse à la place des espèces individuelles pour améliorer les performances de bioprocédés allant de la synthèse industrielle de molécules pour des applications médicales à la détoxification environnementale.

En collaboration avec nos partenaires, nous étudions des interactions métaboliques fondamentales au moyen de consortiums générés synthétiquement de souches modifiées d'E. coli, ainsi que les applications biotechnologiques de consortiums algues-bactéries. Grâce à l'optogénétique, nous explorons également le contrôle dynamique de consortiums pour l'optimisation des processus de croissance, de coexistence et de biosynthèse.